古墓探索是游戏的核心玩法之一，解谜和寻找路径是关键。比如在圣胡安教会古墓中，通关需要完成三十四步操作，每一步都要仔细观察环境。镜子古墓则需要转动四面镜子，让阳光折射到特定柱子上，中间平台攀爬后互动石碑就能完成。隐秘之城古墓的机关需要调整光照顺序，解密时角色还会给出提示。库阿克雅库古墓分为十个步骤，耐心跟着指引就能破解。
废弃村庄古墓的入口通常藏在石头建筑群或悬崖边缘，用武器打开封堵的墙壁就能进入。古墓内部通常是大型石室，中心石碑是解谜重点。这里需要点亮四个火炬启动齿轮，每个火炬位置不同，东侧第一个，其余三个分散在石室周围。每点亮一个火炬，石碑会部分开启，最终解锁新区域并获得关键技能。记得多利用环境，比如攀爬石柱或借助壁画线索。
遇到旋转机关或齿轮谜题时，绳索箭矢是神器。比如连接两个转轴可以启动机器，跳上旋转爬梯要注意躲避障碍物。如果卡关，可以试试用绳索箭矢固定拉环开关，或者扯掉封堵的木条。有些古墓需要潜水，拿到呼吸器后才能探索水下部分，比如基特城澡堂任务。水下机关通常和油罐或齿轮联动，射击油罐能炸开密室。
多使用生存本能高亮可互动物品，尤其是限时动作的关卡。普通难度下通道会有白色油漆提示，困难模式则完全依赖观察。古墓中的宝藏和文物往往藏在隐蔽角落，比如断桥下方或崖壁缝隙。如果遇到霸王龙或猛虎类敌人，优先解决再继续解谜。
