净眼是火影忍者中一种强大的瞳术，其进化过程分为初级、中级和高级三个阶段。初级净眼主要提升角色的感知能力和战斗技巧，包括感知增强、洞察力、防御力提升和攻击力提升等基础能力。这些能力建议全加，为后续进化打下坚实基础。进化到初级净眼需要完成特定剧情任务并积累足够的查克拉控制经验。
中级净眼是净眼技能的进阶阶段，主要提升角色的战斗力和特殊能力。这个阶段解锁瞬身术、幻术感知、忍术增幅和查克拉控制等关键技能。这些技能同样建议全加，特别是瞬身术和查克拉控制对战斗流畅性影响显著。达到中级净眼需要完成更高难度的副本挑战，并在实战中积累足够的瞳术使用经验。
高级净眼是净眼技能的最高阶段，解锁空间感知、时间感知、查克拉凝聚和忍术融合等顶级能力。这些能力使角色在战斗中更加灵活，能把握关键时机并释放强大忍术。进化到高级净眼需要完成特定角色剧情线，并收集稀有的进化材料。这个阶段的技能加点需要根据角色定位进行调整，输出型角色优先加查克拉凝聚，辅助型则侧重空间感知。
净眼的进化与角色血统密切相关，日向一族和大筒木血统的角色更容易触发进化条件。在游戏过程中需要注意收集相关血统道具，这些道具可通过特定剧情或高难度任务获取。同时需要平衡其他属性发展，过度侧重瞳术可能导致角色整体能力失衡。
净眼在战斗中具有强大优势，能感知查克拉流动并预判敌人动作。合理运用净眼能力可以显著提升战斗效率，特别是在对抗拥有写轮眼或轮回眼的对手时。但需要注意净眼使用会消耗大量查克拉，需要搭配适当的查克拉恢复手段。
净眼的最终形态与白眼的进化路线存在关联，部分学者认为净眼可能是白眼的更高级形态。游戏中对这一设定有所保留，为后续内容更新留下空间。玩家在培养净眼时需要保持耐心，其进化过程相比其他瞳术更为缓慢但回报显著。
