城市独立是游戏机制中的重要环节，主要受到忠诚度系统的直接影响。忠诚度是衡量城市归属感的核心指标，当忠诚度降至零时，城市将脱离原文明控制成为自由城市。忠诚度受多种因素综合影响，包括人口数量、周边城市压力、宜居度、宗教信仰、总督任命以及政策卡选择等。城市人口越多，对原文明的忠诚度基础值越高；反之人口稀少的偏远城市更容易受外部压力影响而叛变。周边敌对文明的高人口城市会产生忠诚度压力，这种压力会随着距离增加而衰减，但若多个敌方城市形成包围态势，独立风险将显著提升。
宜居度是另一个关键变量，当城市处于不满或暴动状态时，忠诚度会持续下降。确保奢侈品资源供给、建造娱乐设施以及合理控制人口规模都能有效维持宜居度。宗教信仰的统一性也会作用于忠诚度，若城市信仰与所属文明不同，且受到外部宗教压力，叛变概率将大幅增加。总督的派驻能显著提升城市忠诚度，不同总督的特殊技能还能提供额外加成，例如维克托的军事管制效果。政策卡中的驻军忠诚度加成、黄金时代增益等临时性措施也能在关键时刻稳定局势。
自由城市是独立后的过渡状态，这类城市会暂时保持中立，但会持续受到周边文明的忠诚度压力影响。若某文明对自由城市的忠诚度压力累计达到最大值，该城市将自动归附。埃莉诺的特殊能力可以跳过自由城市阶段，直接吸收忠诚度归零的城市。需军事征服获得的城市初始忠诚度极低，若未及时采取稳定措施很容易再次叛变。同时占领多个相邻城市可以形成忠诚度互助网络，降低独立风险。
地理因素在独立机制中扮演重要角色。远离文明核心区域的飞城，或位于敌对文明腹地的前线城市都面临更高风险。淡水资源的缺失会加剧住房压力，间接影响忠诚度稳定性。自然奇观和某些奇观如阿尔罕布拉宫能提供区域性忠诚度加成。在黑暗时代，所有城市忠诚度衰减速度加快，需要优先部署总督或调整政策卡组。黄金时代则能减缓衰减并提供吸收周边城市的机会，这种时代交替带来的波动需要提前规划应对策略。
文化输出和旅游业绩会产生隐性影响，高文化值文明能对周边城市施加更持久的忠诚度压力。摇滚乐队和间谍的破坏活动可以直接削减目标城市忠诚度，属于主动干预手段。当发现城市出现红色闪烁警告标志时，表明其已进入叛变倒计时，通过紧急调派总督、变更政策或军事压制周边敌对城市等措施可能挽回局势。系统通常会在通知栏提前预警忠诚度危机，密切观察这些信号有助于防范未然。
城市独立是多重机制动态作用的结果，需要从人口管理、区域规划、军事部署和文化渗透等多维度建立防御体系。保持城市间距合理、及时扩展疆域形成连续领地、灵活运用总督和政策卡组合，是预防分裂的有效途径。对于不可避免的自由城市，可通过快速提升自身文化影响力或军事占领重新控制。
